Vega, la librarie utilisée par ggvis, permet de faire des cartes choroplèthes : http://trifacta.github.io/vega/editor/index.html?spec=choropleth
Du coup, peut-être l'utiliser pour rendre les cartes en version web - peut-être le cas échéant en écrivant le code nécessaire pour intégrer la carto à ggvis ?