Skip to content

Dades públiques plataforma covid vigilància

Notifications You must be signed in to change notification settings

icra/sars-aigues

Repository files navigation

https://doi.org/10.5281/zenodo.4147073

sars-aigues

  • Exportació de les dades de https://sarsaigua.icra.cat/

  • Les dades d'aquest repositori són propietat de l'Agència de Salut Pública de Catalunya (ASPCAT) i l'Agència Catalana de l'Aigua (ACA).

  • Dades públiques extretes de la plataforma covid-vigilancia desenvolupada per ICRA.

  • Dades de concentració de diversos gens del virus SARS-CoV-2 calculades a 56 depuradores catalanes, expressades en CG/L (còpies genòmiques per litre d'aigua residual).

  • Les columnes del set de dades són:

    • id mostra: Identificador de la mostra (XXXX-aaaa-mm-dd)
    • depuradora: Nom de la depuradora
    • LD (CG/L): Còpia genòmiques del límit de detecció teòric equivalent al mínim de copies detectables. Concentracions de les dianes N1, N2, IP4 i E iguals a aquest valor corresponen a reaccions sense senyal detectable (N1, N2, IP4, E = LD → No Detectat)
    • N1 (CG/L): Còpia genòmiques de la diana N1 (fragment de la Nucleocapsida) per litre d’aigua residual
    • N2 (CG/L): Còpia genòmiques de la diana N2 (fragment de la Nucleocapsida) per litre d’aigua residual
    • IP4 (CG/L): Còpia genòmiques de la diana IP4 (fragment de la Polimerasa Viral) per litre d’aigua residual
    • E (CG/L): Còpia genòmiques de la diana E (fragment de la Proteïna d’envolcall) per litre d’aigua residual
    • Cabal últimes 24h (m3): Cabal mesurat durant el període de mostreig 24h en m3
    • Pluja (mm): Pluja en mm
    • Observacions
    • Valor Puntual: Valor calculat per la senyal d'una única rèplica d'una sola diana genètica.

Variants detectades

El novembre de 2025 es van incloure les dades de les variants detectades a les EDARs en format JSON.

About

Dades públiques plataforma covid vigilància

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

No packages published

Contributors 2

  •  
  •  

Languages